L'aventure et l'action battent leur plein avec l'arrivée de Mewtwo, un Pokémon de conception biogénétique créé à partir de l'ADN de Mew, le plus rare de tous les Pokémons. Bien décidé à prouver sa supériorité, Mewtwo force Ash, Pikachu et tous les autres à livrer un match comme aucun Pokémon n'en a jamais vu: Mewtwo contre Mew, les Superclones contre les Pokémons. L'affrontement par excellence avec comme enjeu l'avenir du monde!